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안녕하세요.
EFS의 경우 애플리케이션 코드 작성/변경 없이 스토리지를 EC2 OS에서 마운트 하기만 하면 스토리지로 바로 사용 가능합니다.
S3의 경우 아래 링크의 Java SDK 예시처럼 S3 버킷을 애플리케이션에서 사용하기 위해서는 코드 작성/변경이 필요합니다.
https://docs.aws.amazon.com/ko_kr/sdk-for-java/v1/developer-guide/examples-s3-transfermanager.html
설명이 도움이 되었길 바랍니다.
감사합니다.